Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aph1cQ9DCZ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms