Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdf2Q9DCT5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms