Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap3s1Q9DCR2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap3s1Q9DCR2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms