Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms