Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3fQ9DCH4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms