Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmg20aQ9DC33 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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