Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf6Q9DBU5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms