Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med29Q9DB91 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms