Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4Q9DAW6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf4Q9DAW6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms