Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
3110070M22RikQ9DAQ7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms