Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms