Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms