Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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