Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jam3Q9D8B7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms