Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1Q9D883 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af1Q9D883 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms