Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms