Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capns2Q9D7J7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capns2Q9D7J7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms