Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms