Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc8Q9D753 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc8Q9D753 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms