Protein–RNA interactions for Protein: Q9D701

Upk3bl1, Uroplakin-3b-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bl1Q9D701 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upk3bl1Q9D701 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms