Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop56Q9D6Z1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms