Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbe1Q9D6Y9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbe1Q9D6Y9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms