Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ca13Q9D6N1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ca13Q9D6N1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms