Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttc9bQ9D6E4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttc9bQ9D6E4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms