Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc7Q9D541 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms