Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Fam227bQ9D518 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Fam227bQ9D518 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam227bQ9D518 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Fam227bQ9D518 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Fam227bQ9D518 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Fam227bQ9D518 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Fam227bQ9D518 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam227bQ9D518 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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