Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf6Q9D4J7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms