Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms