Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmntd1Q9D4C1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms