Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms