Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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