Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms