Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms