Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syf2Q9D198 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms