Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Hddc3Q9D114 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hddc3Q9D114 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hddc3Q9D114 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hddc3Q9D114 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Hddc3Q9D114 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Hddc3Q9D114 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hddc3Q9D114 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Hddc3Q9D114 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Hddc3Q9D114 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Hddc3Q9D114 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Hddc3Q9D114 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Hddc3Q9D114 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Hddc3Q9D114 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Hddc3Q9D114 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Hddc3Q9D114 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Hddc3Q9D114 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Hddc3Q9D114 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms