Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lsm12Q9D0R8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms