Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ift27Q9D0P8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms