Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Zbed3Q9D0L1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms