Protein–RNA interactions for Protein: Q9D030

Twist2, Twist-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist2Q9D030 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Twist2Q9D030 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Twist2Q9D030 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms