Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms