Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shmt2Q9CZN7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms