Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc77Q9CZH8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms