Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Thumpd2Q9CZB3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thumpd2Q9CZB3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms