Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms