Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmtm6Q9CZ69 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm6Q9CZ69 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm6Q9CZ69 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm6Q9CZ69 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmtm6Q9CZ69 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms