Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snf8Q9CZ28 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snf8Q9CZ28 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms