Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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