Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms