Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Utp23Q9CX11 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms