Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pin4Q9CWW6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms